Webプログラマの年収相場は？

Webプログラマの年収は、300万～1000万程度と大変幅があり、

個人のスキルによる差がとても大きい業界ですが、年次にもよりますが、
正社員としての平均的な年収は400～500万程度と言われています。

Webプログラマとして年収アップを図りたい場合には、その時代に主流になっているプログラミングのスキルを取得する事が必要です。
現在であれば、PHPを中心としたLAMP環境での3年以上の開発経験や、ソーシャルメディアやウェブサービスの開発プロジェクト経験などでしょうか。

これらのスキル・経験がある人材は引く手あまたですので、転職に伴い、大幅な年収アップが出来る可能性が高いです。

Webプログラマの年収の相場・平均値については、エリアによって変動はありますが、東京都内でスキルがしっかりある人であれば、400~600万の間くらいじゃないでしょうか？

DeNAさんが、「新卒エンジニアスペシャリスト採用」という制度で、新卒エンジニアに初年度から、最高年収1000万円を提示する制度を発表するなど、Web系メガベンチャーでは一部のエンジニアに高給を提示するケースも出てきてはいますね。

大手Sir等のシステムエンジニア職においては、PLやPMなど管理職に上がっていく事で、昇給を見込みやすい点はありますが、
Web業界やスタートアップ、ベンチャー企業については、正直、社内昇格で給与が上がるよりも、スキルを身につけた上で、
転職時に給与アップ前提での内定オファーが提示されるケースが多いように思いますね。